Verifique neste artigo como realizar o encerramento do MDF-e.

Como Resolver

1. No Shop, clique na aba Vendas → Emissão de MDF-e.
2. Selecione o MDF-e e clique em Encerrar MDF-e (O MDF-e precisa estar autorizado).
3. Basta aguardar o retorno da sefaz para que o MDF-e seja encerrado.

O Status não sai de encerramento pendente:

1. Selecione o documento e clique novamente em Encerrar MDF-e.
2. Clique em Atualizar Status.
3. Caso o status ainda não atualize, clique em "Verificar MDF-e sem encerramento" para forçar a importação.