A rejeição "E979: O número do lote do contribuinte informado, já existe." ocorre no sistema da Nota Fiscal de Serviço eletrônica (NFS-e) quando você tenta enviar um lote de notas com um  número de lote que já foi utilizado anteriormente  e processado pela prefeitura  

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Compreendendo a Rejeição

Em resumo, a rejeição "E979: O número do lote do contribuinte informado, já existe." acontece porque:

1. Duplicidade:  Você está tentando enviar um arquivo com uma numeração que a prefeitura já recebeu e processou anteriormente.
   
   
2. Reenvio de Erro:  Você tentou enviar novamente um lote que falhou na resposta, mas que o servidor da prefeitura já havia gravado.

Solução

1. Consulte no site da prefeitura: Confirme no portal da prefeitura se a nota consta lá com o mesmo número e RPS do sistema.
   
   
2. Confirmando a nota autorizada na prefeitura: Autorize manualmente no sistema:
   
   

   1. Localize a nota fiscal desejada na listagem dentro do Faturamento.

   2. Clique com o botão direito sobre a nota selecionada.

   3. No menu que aparecerá, selecione a opção Inserir dados de autorização manualmente.

   4. Uma janela será aberta. Preencha as informações solicitadas (como número da nota e data de autorização) conforme os dados que você visualizou no site da prefeitura.

   5. Clique em Ok para confirmar.
      
      

      Desta forma, o sistema não irá gerar o layout para impressão. Você deve imprimi-la diretamente no site da prefeitura.