Como resolver:

  1. Localize na bandeja do Windows o NFeasy e clique com o botão direito selecionando a opção Abrir tela principal.

  2. Clique em .
  3. Selecione a empresa e clique em .
  4. Clique em .
  5. Selecione o certificado que deseja utilizar. 
  6. Clique em OK.
  7. Basta e o certificado já estará configurado.
  8. Para testar a comunicação poderá ir na aba Testes de certificado e clicar no botão .