Para fazer uma baixa com data retroativa, é feito da mesma forma que a baixa com data atual, só é necessário alterar a data da baixa, verifique:

1. Acesse a aba Financeiro → Clique em A receber ou  A pagar, depende do título que irá baixar.
2. Localize o título, marque o check box e informe o valor que será baixado.
3. Irá habilitar um campo no final da tela, com o título marcado, como abaixo:
   
   
   
   
4. Informe o banco da baixa, em data de recebimento, coloque a data da baixa (Coloque a data retroativa) , confirme a valor e clique em Baixar.